實(shí)驗(yàn)室的主要研究方向?yàn)椋簼O業(yè)資源養(yǎng)護(hù)與可持續(xù)利用、漁業(yè)生態(tài)環(huán)境與生態(tài)調(diào)控、水產(chǎn)健康養(yǎng)殖與產(chǎn)物資源利用、海洋漁業(yè)種質(zhì)資源與利用。

1、漁業(yè)資源養(yǎng)護(hù)與可持續(xù)利用
    開(kāi)展南海漁業(yè)資源調(diào)查評(píng)估技術(shù)研究，建立漁業(yè)資源監(jiān)測(cè)評(píng)估體系；研究漁業(yè)資源增殖與海洋牧場(chǎng)構(gòu)建技術(shù)，綜合評(píng)價(jià)漁業(yè)資源增殖效果和生態(tài)安全性；開(kāi)展水生野生動(dòng)物保護(hù)生物學(xué)及保護(hù)技術(shù)研究，建立保護(hù)、恢復(fù)和增殖瀕危水生野生動(dòng)物技術(shù)體系；研究南海漁業(yè)生態(tài)系統(tǒng)在自然環(huán)境和人類(lèi)活動(dòng)影響下的變動(dòng)過(guò)程和機(jī)制，建立漁業(yè)資源可持續(xù)利用及管理技術(shù)體系。

2、漁業(yè)生態(tài)環(huán)境保護(hù)與生態(tài)調(diào)控
    開(kāi)展南海漁業(yè)生態(tài)環(huán)境監(jiān)測(cè)與評(píng)價(jià)、漁業(yè)環(huán)境污染生態(tài)與污染效應(yīng)、水產(chǎn)養(yǎng)殖環(huán)境容量、污染調(diào)控與修復(fù)、水生生物多樣性保護(hù)技術(shù)研究，重點(diǎn)研究人工合成化學(xué)物質(zhì)、漁用藥物對(duì)漁業(yè)生態(tài)環(huán)境和水生經(jīng)濟(jì)種類(lèi)的影響效應(yīng)，典型淺海網(wǎng)箱養(yǎng)殖漁場(chǎng)與養(yǎng)殖池塘環(huán)境污染機(jī)制，增養(yǎng)殖水域環(huán)境容量、養(yǎng)殖容量、污染調(diào)控及修復(fù)技術(shù)，典型濕地生態(tài)系統(tǒng)的組成與結(jié)構(gòu)、功能及其評(píng)價(jià)以及人類(lèi)活動(dòng)對(duì)漁業(yè)生態(tài)系統(tǒng)的影響，為漁業(yè)生態(tài)安全提供技術(shù)支撐。

3、海水健康高效養(yǎng)殖
    開(kāi)展池塘與淺海灘涂養(yǎng)殖技術(shù)研究，優(yōu)化養(yǎng)殖生態(tài)調(diào)控技術(shù)，創(chuàng)新海水池塘及灘涂工程化養(yǎng)殖技術(shù)；研究設(shè)施養(yǎng)殖裝備工程技術(shù)、海洋捕撈技術(shù)以及陸基工程化養(yǎng)殖控制技術(shù)，建立南方漁業(yè)工程與設(shè)施養(yǎng)殖技術(shù)體系；開(kāi)展重要養(yǎng)殖品種重大疫病防控技術(shù)研究，構(gòu)建重大疫病監(jiān)測(cè)預(yù)警系統(tǒng)和控制海水養(yǎng)殖動(dòng)物重大病害的綜合調(diào)控防治技術(shù)體系；開(kāi)展高效無(wú)公害飼料配置技術(shù)、動(dòng)物性飼料源替代技術(shù)以及主要養(yǎng)殖對(duì)象的高效飼料營(yíng)養(yǎng)調(diào)節(jié)機(jī)制研究，建立健康高效水產(chǎn)飼料配置及投喂技術(shù)。

4、漁業(yè)種質(zhì)資源保護(hù)與利用
    收集和保存不同地理群體熱帶亞熱帶海洋生物活體種質(zhì)資源，系統(tǒng)評(píng)價(jià)其種質(zhì)特性，建立具有豐富遺傳多樣性的活體種質(zhì)資源庫(kù)；采用群體選育、家系選育、多性狀復(fù)合育種技術(shù)及全基因組選擇育種等技術(shù)，針對(duì)熱帶亞熱帶海域主養(yǎng)品種斑節(jié)對(duì)蝦、卵形鯧鲹、珍珠貝等開(kāi)展遺傳選育研究，獲得具有優(yōu)良性狀的新品種；開(kāi)展重要經(jīng)濟(jì)價(jià)值的熱帶亞熱帶海洋生物繁殖生理、發(fā)育生物學(xué)和養(yǎng)殖技術(shù)研究，突破苗種規(guī)模化繁育技術(shù)，開(kāi)發(fā)養(yǎng)殖新品種；利用基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和表觀遺傳學(xué)等技術(shù)，開(kāi)展熱帶亞熱帶海洋生物主養(yǎng)品種斑節(jié)對(duì)蝦、珍珠貝和卵形鯧鲹等功能基因發(fā)掘和利用研究，建立高密度遺傳連鎖圖譜，為分子標(biāo)記輔助育種提供技術(shù)支撐。